14 марта 1995 года образовано отделение по Екатериновскому району Управления федерального казначейства Министерства финансов Российской Федерации по Саратовской области (приказ УФК МФ РФ по Саратовской области от 14.03.1995 № 20).

1 сентября 2011 года отделение преобразовано в Отдел № 12 Управления Федерального казначейства по Саратовской области (приказ УФК по Саратовской области от 31.05.2011 № 162).

С октября 2021 года функции отдела № 12 Управления Федерального казначейства по Саратовской области закреплены за отделом № 3 (приказ УФК по Саратовской области от 08.10.2021 № 472).

С 1995 года подразделение возглавлял Горбатов Николай Макарович, а с 2000 года по октябрь 2021 года, более 20 лет, подразделением руководил Попов Вячеслав Иванович. Вячеслав Иванович - внимательный руководитель и отзывчивый человек - эффективно выстраивал процесс работы коллектива подразделения в режиме многозадачности, умело поддерживая позитивную атмосферу в коллективе. В настоящее время Вячеслав Иванович работает в аппарате Управления.

Гордостью района являются земледельцы. Екатериновские хлеборобы по итогам сельскохозяйственных кампаний постоянно входят в тройку лидеров региона по сбору зерновых культур и подсолнечника. Денежные средства на поддержку и развитие сельского хозяйства регулярно выделяются из бюджета, об этом сотрудниками подразделения в районной газете «Слава труду» была опубликована статья, в которой рассмотрен порядок выплаты дотаций и компенсаций в 2001 году сельскохозяйственным товаропроизводителям, а также в 2002 году опубликована статья «Новые требования при заполнении платежных документов» с целью разъяснения участникам бюджетного процесса новых требований, предъявляемых к оформлению платежей. Работа коллектива строилась на понимании важности контроля и целевого использования бюджетных средств, поступающих в реальный сектор экономики, укрепления финансовой дисциплины.

Деятельность подразделения была сосредоточена на добросовестном выполнении возложенных функций и основных задач. На пути к достижению результата много прикладывалось усилий по развитию профессиональных навыков и ответственному исполнению должностных обязанностей.