На основании приказа Управления федерального казначейства Министерства финансов Российской Федерации по Саратовской области от 24.01.1995 № 4 было создано Саратовское отделение федерального казначейства.

14.03.1995 создано Управление по городу Саратову (город Саратов и Кировский район города Саратова), а также Отделения по Ленинскому, Заводскому, Волжскому, Октябрьскому, Фрунзенскому районам города Саратова. С 01.05.1995 Управление по городу Саратову преобразовано в Отделение по городу Саратову (приказ УФК МФ РФ по Саратовской области от 28.04.1995 № 50).

03.07.1995 Саратовское отделение федерального казначейства ликвидировано (приказ УФК МФ РФ по Саратовской области от 03.07.1995 № 79). Создано Контрольно-операционное отделение федерального казначейства по городу Саратову, которое стало правопреемником ликвидированного отделения (приказ УФК МФ РФ по Саратовской области от 12.07.1995 № 83). В целях совершенствовании структуры территориальных органов Федерального казначейства по Саратовской области Контрольно-операционное отделение федерального казначейства по городу Саратову было ликвидировано (приказ УФК МФ РФ по Саратовской области от 29.01.1997 № 5) и на его базе вновь создано Отделение федерального казначейства по городу Саратову. Этим же приказом было ликвидировано Отделение по Кировскому району города Саратова.

Позднее в целях перехода на трехзвенную систему управления территориальных органов федерального казначейства по Саратовской области и повышения оперативности в финансировании государственных программ были упразднены отделения по: Волжскому, Фрунзенскому, Октябрьскому, Ленинскому, Заводскому районам города Саратова.

Приказом Управления Федерального казначейства по Саратовской области от 05.05.2005 № 38 Отделение федерального казначейства по городу Саратову переименовано в Отделение по городу Саратову, которое состояло из:

- отдела расходов и обслуживания силовых ведомств;

- отдела кассового обслуживания исполнения бюджетов;

- отдела бюджетного учета и отчетности;

- отдела информационных технологий;

- административного отдела.

3 сентября 2012 года Отделение по городу Саратову было преобразовано в Отдел № 38 Управления Федерального казначейства по Саратовской области (приказ УФК по Саратовской области от 31.05.2012 № 210).

Подразделение возглавляли:

- с 25.01.1995 по 10.07.1995 Саютин Александр Федорович;

- с 12.07.1995 по 17.01.1997 Кабанов Виталий Николаевич;

- с 10.01.1997 по 08.01.1998 Наташкин Валерий Викторович;

- c 02.10.1998 по 17.02.2006 Лабазнов Евгений Анатольевич;

- с 20.02.2006 по 31.07.2006 и.о. Самойлов Александр Константинович;

- с 01.08.2006 по 05.04.2021 Яшина Татьяна Николаевна.

За годы работы Татьяна Николаевна вместе с коллективом прошла многие вехи в развитии казначейской системы, успешно решая поставленные задачи, беря на себя ответственность в решении непростых задач. Татьяна Николаевна обладала незаурядными организационными способностями, сумела создать в отделе атмосферу ответственного отношения к порученному делу и укрепить трудовую дисциплину.

Под руководством Яшиной Т.Н. коллектив участвовал в переводе клиентов на систему удаленного финансового документооборота (СУФД-online), организовывал взаимодействие клиентов с государственной интегрированной информационной системой управления общественными финансами «Электронный бюджет», принимал участие в выверке справочников и перечня государственных и муниципальных услуг (ГМУ), а также в работе с клиентами по размещению сведений об учреждениях на Официальном сайте ГМУ.

Непосредственное участие в утверждении основ, традиций и принципов работы коллектива приняли специалисты, опыт работы которых в коллективе составляет более 20 лет: Скребцова В.В., Евтеева М.В., Самойлова А.В., Карпова А.Г., Кичан Т.В., Романова С.В., Еременко А.М., Уварова А.А.

С 23.06.2021 по настоящее время коллектив отдела возглавляет Мызникова Валентина Владимировна. Готовность прикладывать максимум усилий для тщательного выполнения возложенных функций, умение эффективно планировать текущий процесс и анализировать, концентрироваться на достижении поставленных целей, работать с высокой степенью самоотдачи – таковы основные трудовые традиции коллектива отдела № 38.